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基于降维的微阵列数据分析.pdf 51页

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独创性声明 本人声明,所呈交的学位(毕业)论文,是本人在指导教师的指导下独立完成 的研究成果,并且是自己撰写的。尽我所知,除了文中作了标注和致谢中已作了 答谢的地方外,论文中不包含其他人发表或撰写过的研究成果。与我一同对本研 究做出贡献的同志,都在论文中作了明确的说明并表示了谢意,如被查有侵犯他 人知识产权的行为,由本人承担应有的责任。 学位(毕业)论文作者亲笔签名:嚷嚷呔 日期: 沙tI.I.矿 论文使用授权的说明 本人完全了解福建农林大学有关保留、使用学位(毕业)论文的规定,即学校 有权送交论文的复印件,允许论文被查阅和借阅;学校可以公布论文的全部或部 分内容,可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。 保密,在 年后解密可适用本授权书。 口 不保密,本论文属于不保密。 ∥ 学位(毕业)论文作者亲笔签名:甏裳苠 日期:弘I(.b,苦 …牒…:参2u吼一¨弓 福建农林大学硕士学位论文 目录 摘 要……………………………………………………………………………………………………………………………I Abstract.…………………………………………………………………………………………………………………..………II l绪论…………………………………………………………………………………………………………………………….1 1.1课题研究的背景及意义…………………………………………………………………l 1.1.1微阵列简介………………………………………………………………………l 1.1.2微阵列基因表达数据……………………………………………………………2 1.1.3课题研究目的和意义…………………………………………………………。4 1.2基因表达数据分析方法研究现状………………………………………………………5 1.3本文主要研究内容及组织结构…………………………………………………………6 2线性降维………………………………………………………………………………………8 2.1主成分分析(PCA)………………………………………………………………….8 2.1.1主成分定义………………………………………………………………………9 2.1.2主成分计算步骤………………………………………………………………….9 2.2多维尺度变换(MDS)………………………………………………………………10 2.2.1基本思想…………………………………………………………………………lO 2.2.2 0 MDS的计算步骤………………………………………………………………..1 2.3 因子分析 (FA)…………………………………………………………………….1l 2.3.1因子分析原理……………………………………………………………………ll 2.3.2因子分析计算步骤……………………………………………………………。12 2.4支持向量机…………………………………………………………………………….14 2.4.1SVM的基本思想………………………………………………………………。14 2.4.2 SVM分类………………………………………………………………………。14 2.5线性降维实验分析………………………………………………………………………16 2.5.1数据预处理……………………………………………………………………..16 2.5.2数据线性降维与识别率计算…………………………………………………16 2.5.3 PCA降维分析…………………………………………………………………l7 2.5.4 MDS降维分析

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